Protein–RNA interactions for Protein: L7N1X0

Gm28044, Predicted gene, 28044, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28044L7N1X0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28044L7N1X0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms