Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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