Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo1J3QME6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms