Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21060J3KMU4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21060J3KMU4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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