Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms