Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms