Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sptbn5F6UCX4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn5F6UCX4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms