Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm28305F6U473 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm28305F6U473 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28305F6U473 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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