Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa35E9QLQ1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms