Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

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Length 1,021 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pdzd7E9Q9W7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pdzd7E9Q9W7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pdzd7E9Q9W7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pdzd7E9Q9W7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd7E9Q9W7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd7E9Q9W7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd7E9Q9W7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd7E9Q9W7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd7E9Q9W7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd7E9Q9W7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd7E9Q9W7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd7E9Q9W7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd7E9Q9W7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd7E9Q9W7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd7E9Q9W7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd7E9Q9W7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms