Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf169E9Q7F2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf169E9Q7F2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms