Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myo5cE9Q1F5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Myo5cE9Q1F5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myo5cE9Q1F5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms