Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt78E9Q0F0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt78E9Q0F0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms