Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm9972E9Q053 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9972E9Q053 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9972E9Q053 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9972E9Q053 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9972E9Q053 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9972E9Q053 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9972E9Q053 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9972E9Q053 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9972E9Q053 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9972E9Q053 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9972E9Q053 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9972E9Q053 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms