Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcom1E9PZ54 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms