Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms