Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms