Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb3D3Z6J4 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms