Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930455H04RikD3Z622 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms