Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc6D3YZP9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc6D3YZP9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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