Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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