Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cspp1B2RX88 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms