Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cfap58B2RW38 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms