Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AU015836B2RUM3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms