Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CK137956B1AYM9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms