Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssxb8B1AY40 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms