Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
1700042G07RikB1AUF7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
1700042G07RikB1AUF7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms