Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem238A9JSM3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms