Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prr16A3KMN5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prr16A3KMN5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prr16A3KMN5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prr16A3KMN5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prr16A3KMN5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prr16A3KMN5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr16A3KMN5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms