Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf2A3KGV1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms