Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plcb2A3KGF7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms