Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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