Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Upf2A2AT37 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upf2A2AT37 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms