Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap5A2AGT5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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