Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc163A2AGD7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms