Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Pramef6A2A8M8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef6A2A8M8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms