Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
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