Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp5Q9Z2P8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms