Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mbd2Q9Z2E1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms