Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms