Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtmr1Q9Z2C4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms