Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn6Q9Z262 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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