Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn8Q9Z260 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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