Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3b1Q9Z1T1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b1Q9Z1T1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms