Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Clip2Q9Z0H8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Clip2Q9Z0H8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Clip2Q9Z0H8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Clip2Q9Z0H8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms