Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod3Q9R0E1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms