Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Nek3Q9R0A5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Nek3Q9R0A5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Nek3Q9R0A5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Nek3Q9R0A5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Nek3Q9R0A5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Nek3Q9R0A5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Nek3Q9R0A5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Nek3Q9R0A5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Nek3Q9R0A5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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