Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col4a4Q9QZR9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms