Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnnt3Q9QZ47 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms