Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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